腸腦軸是腸道與大腦透過迷走神經、壓力荷爾蒙、免疫與腸道菌代謝物進行的雙向溝通：壓力荷爾蒙 CRH 會增加結腸收縮與小腸通透性，追蹤研究也估算，在腸胃與情緒問題都出現的人當中，約三分之二是腸胃症狀先出現；人體九成以上的血清素在腸道合成，但難以直接進入大腦；益生菌研究結果不一致，飲食改善可作為憂鬱症的輔助，但都不能取代專業治療。